1955년 미국 남장로교 한국선교회에 의해호남지역의 농어촌 교회 교역자 양성을 위해 광주권에 개설된 호남성경학교는

농촌 교역자를 위한 고등교육 기관의 필요성에 따라 1961년 호남성경학교, 광주 야간 신학교, 그리고 순천 매산 신학교 등 세 학교가 통합되어 호남신학원으로 발전되었다.

그 후 1963년 호남신학교로 개칭되고, 1984년 상급학교 입학에 있어 4년제 대학을 졸업한 자와 동등한 학력이 인정되는 학교가 되었다.

1988년에는 교회음악과를 증설하고 1990년에는 4년제 대학, 1992년에는 대학교가 되었으며, 1995년에는 신학대학원 인가, 1996년과 1997년에는 대학원 증과가 이루어져 오늘에 이르렀다.